Σε αυτό το τμήμα φιλοξενούνται φυτικά είδη, που σχετίζονται με την Αρχαία Ελληνική μυθολογία και που έχουν αναφερθεί από Έλληνες και Ρωμαίους συγγραφείς, όπως ο Θεόφραστος και ο Πλίνιος. Οι επισκέπτες μπορούν να δουν πολλούς θάμνους και δέντρα αφιερωμένα στους θεούς, που περιγράφηκαν από αρχαίους συγγραφείς σε μύθους, αλλά και στα πρώτα βιβλία βοτανικής. Για παράδειγμα το κυπαρίσσι (Cupressus sempervirens) που συνδέεται με τον μύθο του νέου Κυπάρισσου, τον όποιο ο θεός Απόλλωνας μεταμόρφωσε σε κυπαρίσσι. Η δάφνη (Laurus nobilis) μια νύμφη που μεταμορφώθηκε σε δέντρο, την οποία αγάπησε ο θεός Απόλλωνας. Το πεύκο (Pinus pinea) με τη μεταμόρφωση της νύμφης Πίτυς, την οποία ερωτεύτηκε ο Πάνας. Η λευκή λεύκη (Populus alba) με τη μεταμόρφωση της νύμφης Λεύκη, κόρη του Ωκεανού, την οποία αγάπησε ο Πλούτωνας. Άλλα φυτικά είδη έχουν πιο περίπλοκες ιστορίες, με πολλές εκδοχές η καθεμία. Η αμυγδαλιά (Prunus dulcis) που συνδέεται με την γέννηση του Άττη, η ροδιά (Punica granatum) που συνδέεται με την αρπαγή της Περσεφόνης, η μηλιά (Malus domestica) που συνδέεται με την κρίση του Πάρη και η μουριά μαύρη (Morus nigra) που συνδέεται με τον θάνατο του Πύραμου και της Θίσβης. Μερικά δένδρα αναφέρονται στην αρχαία λατρεία των νυμφών Αμαδρυάδων, όπως ο πρίνος, η δρυς και η βελανιδιά (Quercus spp.), η μουριά μαύρη, η καρυδιά (Juglans regia) και η συκιά (Ficus communis). Κάποια άλλα φυτά είναι αφιερωμένα στους θεούς όπως η λυγαριά της Ήρας (Vitex agnus-castus) που συμβολίζει την αγνότητα, ο πρίνος, η δρυς και η βελανιδιά ιερά δέντρα αφιερωμένα στο Δία, η δάφνη αφιερωμένη στον θεό Απόλλωνα και η μυρτιά (Mirtus communis) αφιερωμένη στην θεά Αφροδίτη.
<link file:5725>Ιστορικός Κήπος